Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Frmpd1A2AKB4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Frmpd1A2AKB4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms