Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lcn6A2AJB9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms