Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frmpd4A2AFR3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Frmpd4A2AFR3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms