Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prdm2A2A7B5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm2A2A7B5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms