Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm27029A2A4P4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms