Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp1bA1Z198 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms