Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930469K13RikA0A286YDB2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms