Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Speer3W4VSP1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms