Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Crlf3Q9Z2L7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Crlf3Q9Z2L7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms