Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms