Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Robo3Q9Z2I4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Robo3Q9Z2I4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms