Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H7

Gipc2, PDZ domain-containing protein GIPC2, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc2Q9Z2H7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gipc2Q9Z2H7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gipc2Q9Z2H7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gipc2Q9Z2H7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gipc2Q9Z2H7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gipc2Q9Z2H7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gipc2Q9Z2H7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gipc2Q9Z2H7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gipc2Q9Z2H7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gipc2Q9Z2H7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gipc2Q9Z2H7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gipc2Q9Z2H7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gipc2Q9Z2H7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gipc2Q9Z2H7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gipc2Q9Z2H7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gipc2Q9Z2H7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms