Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mbd3Q9Z2D8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms