Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pdpk1Q9Z2A0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pdpk1Q9Z2A0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pdpk1Q9Z2A0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pdpk1Q9Z2A0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pdpk1Q9Z2A0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pdpk1Q9Z2A0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pdpk1Q9Z2A0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pdpk1Q9Z2A0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pdpk1Q9Z2A0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pdpk1Q9Z2A0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms