Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn7Q9Z261 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn7Q9Z261 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms