Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccne2Q9Z238 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms