Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ap3b1Q9Z1T1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ap3b1Q9Z1T1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms