Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VarsQ9Z1Q9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms