Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lgr5Q9Z1P4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr5Q9Z1P4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms