Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms