Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z184

Padi3, Protein-arginine deiminase type-3, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi3Q9Z184 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi3Q9Z184 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi3Q9Z184 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi3Q9Z184 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi3Q9Z184 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi3Q9Z184 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi3Q9Z184 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi3Q9Z184 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi3Q9Z184 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi3Q9Z184 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Padi3Q9Z184 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms