Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shcbp1Q9Z179 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shcbp1Q9Z179 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms