Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup160Q9Z0W3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup160Q9Z0W3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms