Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx1Q9WV80 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx1Q9WV80 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms