Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU62

Incenp, Inner centromere protein, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IncenpQ9WU62 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IncenpQ9WU62 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
IncenpQ9WU62 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms