Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lemd3Q9WU40 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lemd3Q9WU40 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms