Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema6cQ9WTM3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms