Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sorbs3Q9R1Z8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms