Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfwd2Q9R1A8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms