Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NrkQ9R0G8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NrkQ9R0G8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms