Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zeb2Q9R0G7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zeb2Q9R0G7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms