Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plod3Q9R0E1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Plod3Q9R0E1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms