Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr54Q9R0D8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr54Q9R0D8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms