Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamc3Q9R0B6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lamc3Q9R0B6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms