Protein–RNA interactions for Protein: Q9R088

Tk2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk2Q9R088 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tk2Q9R088 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tk2Q9R088 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tk2Q9R088 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tk2Q9R088 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms