Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS3

Numb, Protein numb homolog, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumbQ9QZS3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NumbQ9QZS3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms