Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Npas3Q9QZQ0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms