Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Copg1Q9QZE5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms