Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc4Q9QZD4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms