Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trpc3Q9QZC1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpc3Q9QZC1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms