Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr4a3Q9QZB6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr4a3Q9QZB6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms