Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Six6Q9QZ28 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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