Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Pkp3Q9QY23 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Pkp3Q9QY23 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp3Q9QY23 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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