Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cbx8Q9QXV1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cbx8Q9QXV1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms