Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rai2Q9QVY8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms