Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms