Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrfQ9JM73 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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