Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scamp4Q9JKV5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scamp4Q9JKV5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms