Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Ldb3Q9JKS4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Ldb3Q9JKS4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ldb3Q9JKS4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ldb3Q9JKS4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ldb3Q9JKS4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ldb3Q9JKS4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ldb3Q9JKS4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ldb3Q9JKS4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ldb3Q9JKS4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ldb3Q9JKS4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ldb3Q9JKS4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ldb3Q9JKS4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ldb3Q9JKS4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ldb3Q9JKS4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms