Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
AtrQ9JKK8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms